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提速近10倍！基于深度学习的全基因组选择新方法来了******
近日，中国农业科学院作物科学研究所、三亚南繁研究院大数据智能设计育种创新团队联合多家单位提出利用植物海量多组学数据进行全基因组预测的深度学习方法, 可以实现育种大数据的高效整合与利用，将助力深度学习在全基因组选择中的应用，为智能设计育种及平台构建提供有效工具。相关研究成果发表在《分子植物（Molecular Plant）》上。
全基因组选择作为新一代育种技术，通过构建预测模型，根据基因组估计育种值进行早期个体的预测和选择，从而缩短育种世代间隔，加快育种进程，节约成本，推动现代育种向精准化和高效化方向发展。
统计模型作为全基因组选择的核心，极大地影响了全基因组预测的准确度和效率。传统预测方法基于线性回归模型，难以捕捉基因型和表型间的复杂关系。
相较于传统模型，非线性模型（如深度网络神经）具备分析复杂非加性效应的能力，人工智能和深度学习算法为解决大数据分析和高性能并行运算等难题提供了新的契机，深度学习算法的优化将会提高全基因组选择的预测能力。
该研究团队以玉米、小麦和番茄3种作物的4种不同维度的群体数据为测试材料，通过创新深度学习算法框架开发了全基因组选择新方法。
与其他五种主流预测方法相比，该方法有以下优点： 可以利用多组学数据开展全基因组预测；算法设计中包含批归一化层、回调函数和校正线性激活函数等结构，可以有效降低模型错误率，提高运行速度；预测精度稳健，在小型数据集上的表现与目前主流预测模型相当，在大规模数据集上预测优势更加明显；计算时间与传统方法相近，比已有深度学习方法提速近10倍；超参数调整对用户更加友好。
该研究得到了国家重点研发计划、国家自然科学基金、海南崖州湾种子实验室和中国农业科学院科技创新工程等项目的支持。
学术支持
中国农业科学院作物科学研究所
记者
宋雅娟
春节“它经济”升温 宠物寄养服务日趋精细化******
中新网上海1月16日电 (记者 郑莹莹 徐明睿)“早饭9：30左右，1满勺干粮+1/4罐头+1勺益生菌+1颗蛋黄(捏碎)+3颗软骨素+维他命(维生素)6颗+卵磷脂3颗。”在上海浦东新区的一家宠物店内，一只布偶猫的“玻璃房”外贴着一张精细的食谱。
临近新春，沪上宠物寄养升温，服务日趋精细化 徐明睿 摄春节临近，不少萌宠的主人回家探亲或外出过节，路途遥远，携宠不便，沪上宠物寄养服务火速升温。记者走访发现，一方面，春节期间寄养费用有所上升，另一方面，相关服务日趋精细化。
上海某宠物店的店长欧小瑞说，寄养猫狗不比存放物品，宠物在饮食和生活上有很多要求，除了最基本的遛狗、陪猫、喂食、铲屎等，还包括喂药、擦眼睛、拍短视频反馈给客户等各种服务。他会将宠物主人的要求记下并打印出来，贴在每个“房间”外，以便照顾。
临近新春，沪上宠物寄养升温，服务日趋精细化 徐明睿 摄“有些可能要喂鱼油、奶粉，有些要喂药，甚至像加菲(猫)可能每天要擦几次鼻子和眼泪。”欧小瑞说。
上海市静安区某宠物店的寄养主管罗平告知，尽管春节期间的寄养费用比平时贵了大约50%，但其宠物客房也已经基本订满。
临近新春，沪上宠物寄养升温，服务日趋精细化 徐明睿 摄商家们表示，春节宠物寄养涨价的主要原因之一是宠物服务日趋精细化，人工费相应看涨。
上海黄浦区陆家浜路某宠物店的店员张女士表示，部分宠物换了环境后容易产生紧张、不吃东西等应激反应，因此他们会让宠物主人带上一些宠物常用物品，防止它出现应激反应，“自带碗，还有它的床垫，我们会给它一个像家一样的空间。”(完)
临近新春，沪上宠物寄养升温，服务日趋精细化 徐明睿 摄（文图：赵筱尘 巫邓炎） [责编：天天中] 阅读剩余全文（）  视觉焦点
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